Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E9PBE3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
E9PBE3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms