Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PRAMEF25A6NGN4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PRAMEF25A6NGN4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PRAMEF25A6NGN4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PRAMEF25A6NGN4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PRAMEF25A6NGN4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PRAMEF25A6NGN4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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