Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP11Q9Y3A2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UTP11Q9Y3A2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms