Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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USP18Q9UMW8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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