Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIMKLBQ9ULI2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms