Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLCO3A1Q9UIG8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms