Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFMBT1Q9UHJ3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms