Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MLH3Q9UHC1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MLH3Q9UHC1 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms