Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ABCF2Q9UG63 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms