Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NKX1-2Q9UD57 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NKX1-2Q9UD57 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms