Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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COPS7AQ9UBW8 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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COPS7AQ9UBW8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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