Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
COPZ2Q9P299 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms