Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms