Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HCN3Q9P1Z3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms