Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SH3BP4Q9P0V3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4Q9P0V3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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