Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CLN6Q9NWW5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CLN6Q9NWW5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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CLN6Q9NWW5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLN6Q9NWW5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLN6Q9NWW5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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