Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TBCCD1Q9NVR7 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TBCCD1Q9NVR7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms