Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EMILIN3Q9NT22 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms