Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA4BQ9NPR2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms