Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FANCFQ9NPI8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FANCFQ9NPI8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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