Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
POLMQ9NP87 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
POLMQ9NP87 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms