Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LINC00597Q9H2U6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00597Q9H2U6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms