Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FOXQ1Q9C009 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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FOXQ1Q9C009 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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