Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM3Q9BZL3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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