Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM54Q9BYV2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2720 ms