Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP4AQ9BY43 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms