Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VN1R3Q9BXE9 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VN1R3Q9BXE9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms