Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms