Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SPOCK3Q9BQ16 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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SPOCK3Q9BQ16 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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