Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3GL2Q99962 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms