Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PITX2Q99697 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms