Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC22A12Q96S37 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms