Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDC1Q96MU7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDC1Q96MU7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms