Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms