Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTP4Q96DX8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 477.8 ms