Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF3C6Q969F1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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GTF3C6Q969F1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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GTF3C6Q969F1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GTF3C6Q969F1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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