Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms