Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC112Q8NEF3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC112Q8NEF3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC112Q8NEF3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC112Q8NEF3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC112Q8NEF3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC112Q8NEF3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC112Q8NEF3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC112Q8NEF3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms