Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERC6Q8IVU3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERC6Q8IVU3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERC6Q8IVU3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERC6Q8IVU3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERC6Q8IVU3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms