Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNMB4Q86W47 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNMB4Q86W47 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms