Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SNX20Q7Z614 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SNX20Q7Z614 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SNX20Q7Z614 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SNX20Q7Z614 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SNX20Q7Z614 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SNX20Q7Z614 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SNX20Q7Z614 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SNX20Q7Z614 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX20Q7Z614 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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