Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D4Q7Z3S7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms