Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CCDC80Q76M96 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms