Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SUSD1Q6UWL2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms