Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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C10orf55Q5SWW7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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C10orf55Q5SWW7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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C10orf55Q5SWW7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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C10orf55Q5SWW7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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C10orf55Q5SWW7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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C10orf55Q5SWW7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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C10orf55Q5SWW7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C10orf55Q5SWW7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C10orf55Q5SWW7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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