Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CEP170Q5SW79 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP170Q5SW79 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms