Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DUSP28Q4G0W2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms