Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF212Q495C1 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms