Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC153Q494R4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms