Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A52Q3SY17 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms